Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABRAXAS1Q6UWZ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms