Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCIMPQ6UWF3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms