Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BLOC1S2Q6QNY1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BLOC1S2Q6QNY1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BLOC1S2Q6QNY1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms