Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAT1Q6PJG6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRAT1Q6PJG6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRAT1Q6PJG6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRAT1Q6PJG6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRAT1Q6PJG6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRAT1Q6PJG6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms