Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE2Q6PIF2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE2Q6PIF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE2Q6PIF2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE2Q6PIF2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE2Q6PIF2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE2Q6PIF2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE2Q6PIF2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE2Q6PIF2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE2Q6PIF2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms