Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 TSEN2-203ENST00000412698 553 ntTSL 54.86□□□□□ -1.637e-14■■■■■ 54.4
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PRPF8Q6P2Q9 MANBA-205ENST00000508141 549 ntTSL 23.67□□□□□ -1.821e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 TMPO-206ENST00000547214 721 ntTSL 21.54□□□□□ -2.161e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 ATM-218ENST00000532765 610 ntTSL 41.17□□□□□ -2.221e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 PSMC6-209ENST00000555175 752 ntTSL 31.16□□□□□ -2.221e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 C2CD5-207ENST00000537643 548 ntTSL 51.06□□□□□ -2.241e-14■■■■■ 54.4
PRPF8Q6P2Q9 TMPO-211ENST00000552831 743 ntTSL 20.6□□□□□ -2.311e-14■■■■■ 54.4
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PRPF8Q6P2Q9 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 54.4
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PRPF8Q6P2Q9 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 54.1
PRPF8Q6P2Q9 YWHAB-206ENST00000479421 1097 ntTSL 59.34□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 54.1
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PRPF8Q6P2Q9 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.452e-16■■■■■ 53.7
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PRPF8Q6P2Q9 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.976e-9■■■■■ 53.7
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PRPF8Q6P2Q9 KIZ-214ENST00000621366 1397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)1.69□□□□□ -2.143e-9■■■■■ 53.7
PRPF8Q6P2Q9 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 51.52□□□□□ -2.173e-9■■■■■ 53.7
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PRPF8Q6P2Q9 ZFAND5-203ENST00000376956 690 ntTSL 517.37■□□□□ 0.373e-10■■■■■ 53.7
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 53.7
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-10■■■■■ 53.7
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND5-208ENST00000488164 3020 ntTSL 512□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 53.7
PRPF8Q6P2Q9 ZFAND5-201ENST00000237937 5310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-10■■■■■ 53.7
PRPF8Q6P2Q9 XPO1-213ENST00000460037 573 ntTSL 40.71□□□□□ -2.34e-18■■■■■ 53.6
PRPF8Q6P2Q9 IRF3-211ENST00000596644 550 ntTSL 212.6□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 53.6
PRPF8Q6P2Q9 IRF3-224ENST00000599680 472 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 53.6
PRPF8Q6P2Q9 SUN1-234ENST00000493681 526 ntTSL 310.69□□□□□ -0.79e-10■■■■■ 53.6
PRPF8Q6P2Q9 SUN1-230ENST00000477950 575 ntTSL 39.55□□□□□ -0.889e-10■■■■■ 53.6
PRPF8Q6P2Q9 TRIP13-204ENST00000509210 303 ntTSL 36.67□□□□□ -1.344e-60■■■■■ 53.5
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PRPF8Q6P2Q9 METAP1-202ENST00000503247 653 ntTSL 59.02□□□□□ -0.971e-12■■■■■ 53.5
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PRPF8Q6P2Q9 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.411e-12■■■■■ 53.5
PRPF8Q6P2Q9 METAP1-206ENST00000510107 770 ntTSL 50.63□□□□□ -2.311e-12■■■■■ 53.5
PRPF8Q6P2Q9 U2SURP-206ENST00000470400 881 ntTSL 3-0.05□□□□□ -2.423e-8■■■■■ 53.5
PRPF8Q6P2Q9 HERC1-205ENST00000559886 2462 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.828e-8■■■■■ 53.4
PRPF8Q6P2Q9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -09e-12■■■■■ 53.4
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