Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CDC42EP5Q6NZY7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC42EP5Q6NZY7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42EP5Q6NZY7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms