Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE12Q6L8Q7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE12Q6L8Q7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms