Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCSAPQ6IQ19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSAPQ6IQ19 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSAPQ6IQ19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCSAPQ6IQ19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms