Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPPQ6IPU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPPQ6IPU0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms