Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPRIN2Q6IMN6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN2Q6IMN6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN2Q6IMN6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms