Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD4Q6IC98 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD4Q6IC98 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms