Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LEMD1Q68G75 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LEMD1Q68G75 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LEMD1Q68G75 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LEMD1Q68G75 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LEMD1Q68G75 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LEMD1Q68G75 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LEMD1Q68G75 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LEMD1Q68G75 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LEMD1Q68G75 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LEMD1Q68G75 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LEMD1Q68G75 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms