Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC102BQ68D86 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC102BQ68D86 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC102BQ68D86 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms