Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLFN13Q68D06 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN13Q68D06 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN13Q68D06 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms