Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG9BQ674R7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms