Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
RNF123Q5XPI4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RNF123Q5XPI4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RNF123Q5XPI4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms