Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM236Q5W0B7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM236Q5W0B7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms