Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
C9orf84Q5VXU9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
C9orf84Q5VXU9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
C9orf84Q5VXU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
C9orf84Q5VXU9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms