Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QL3Q5VWW1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QL3Q5VWW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1QL3Q5VWW1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms