Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AGAP6Q5VW22 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AGAP6Q5VW22 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AGAP6Q5VW22 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AGAP6Q5VW22 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms