Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RPRD2Q5VT52 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RPRD2Q5VT52 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
RPRD2Q5VT52 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RPRD2Q5VT52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
RPRD2Q5VT52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RPRD2Q5VT52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RPRD2Q5VT52 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms