Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BEND3Q5T5X7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BEND3Q5T5X7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms