Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC3LQ5T215 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC3LQ5T215 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms