Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP70Q5T0N1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP70Q5T0N1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP70Q5T0N1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFAP70Q5T0N1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP70Q5T0N1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP70Q5T0N1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CFAP70Q5T0N1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CFAP70Q5T0N1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms