Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf220Q5T0J3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf220Q5T0J3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf220Q5T0J3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms