Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PERM1Q5SV97 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PERM1Q5SV97 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms