Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM201Q5SNT2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM201Q5SNT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM201Q5SNT2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms