Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCID2Q5JVF3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCID2Q5JVF3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCID2Q5JVF3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms