Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MIA3Q5JRA6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIA3Q5JRA6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms