Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HERC4Q5GLZ8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms