Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM61Q5EBN2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms