Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF542PQ5EBM4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF542PQ5EBM4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms