Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCAF6Q58WW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCAF6Q58WW2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCAF6Q58WW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCAF6Q58WW2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCAF6Q58WW2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms