Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALFQ53S48 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALFQ53S48 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms