Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB6CQ53S08 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB6CQ53S08 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms