Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF394Q53GI3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF394Q53GI3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF394Q53GI3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms