Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL12Q53G59 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms