Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD4Q53EL6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCD4Q53EL6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCD4Q53EL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms