Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRAMD1BQ3KR37 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms