Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HFEQ30201 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HFEQ30201 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HFEQ30201 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HFEQ30201 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HFEQ30201 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HFEQ30201 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HFEQ30201 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HFEQ30201 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HFEQ30201 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HFEQ30201 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
HFEQ30201 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HFEQ30201 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HFEQ30201 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HFEQ30201 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HFEQ30201 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HFEQ30201 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HFEQ30201 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HFEQ30201 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HFEQ30201 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HFEQ30201 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HFEQ30201 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HFEQ30201 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HFEQ30201 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HFEQ30201 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HFEQ30201 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HFEQ30201 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HFEQ30201 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HFEQ30201 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HFEQ30201 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HFEQ30201 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HFEQ30201 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HFEQ30201 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HFEQ30201 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HFEQ30201 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HFEQ30201 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms