Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C15orf59Q2T9L4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf59Q2T9L4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C15orf59Q2T9L4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms