Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSR1Q2NL82 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR1Q2NL82 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms