Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC6LQ2NKX8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms