Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRED3Q2MJR0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRED3Q2MJR0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms