Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX7Q2KHR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX7Q2KHR2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms