Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDO1Q16878 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDO1Q16878 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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