Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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KCNMB1Q16558 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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KCNMB1Q16558 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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KCNMB1Q16558 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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KCNMB1Q16558 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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KCNMB1Q16558 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB1Q16558 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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KCNMB1Q16558 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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KCNMB1Q16558 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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KCNMB1Q16558 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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