Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NTRK3Q16288 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NTRK3Q16288 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NTRK3Q16288 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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