Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TWIST1Q15672 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms